| Contacto |
Bruno Manadas
Center for Neuroscience and Cell Biology
University of Coimbra
3004-517 Coimbra
Portugal
Ph. +351 91 351 03 46
bmanadas@gmail.com
http://cnc.cj.uc.pt/~proteome/
http://cnc.cj.uc.pt/~cbduarte/
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| Localização |
| Biocant campus, Unidade de Serviços Avançados |
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| Equipamento |
Sistema de cromatografia bidimensional acoplado a espectrómetro de massa híbrido (triplo quadropolo-ion trap).
O 4000 QTRAP é um sistema híbrido único (triplo quadrupolo/"ion-trap") que permite combinar a elevada especificidade conferida pelos quadrupolos com o ganho na sensibilidade conferida pela "ion-trap".
No que diz respeito à análise de pequenas moléculas, como os péptidos, este sistema permite obter dados cruciais para a sequenciação de novo e para a identificação de modificações pós-traducionais ao combinar o triplo quadrupolo com a "ion-trap". A fragmentação efectuada na célula de colisão do triplo com varrimento dos produtos de fragmentação na “ion-trap” permite obter mais informação que a conferida por uma fragmentação efectuada apenas dentro da "ion-trap".
Este sistema permite identificar péptidos ou metabolitos no modo “ion-trap” podendo depois proceder à sua quantificação altamente específica no modo triplo quadrupolo usando o método denominado de “Multiple Reaction Monitoring” (MRM). Está igualmente desenhado para a detecção, quantificação e validação de biomarcadores a partir de amostras biológicas.
http://cnc.cj.uc.pt/~proteome/
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| Serviços |
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Identificação de proteínas a partir de digestos proteicos |
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Identificação de metabolitos |
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Quantificação de proteínas (a partir de digestos) e metabolitos (recorrendo em ambos os casos a curvas de calibração ou a calibrantes específicos) |
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Identificação de PTM’s |
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| Requisitos |
| As amostras terão de obedecer aos requisitos da unidade (quantidade e qualidade). O acesso ao equipamento está restrito a pessoas com formação específica de utilização do hardware e software (Ultimate 3000 - LCPackings; 4000 QTRAP MSMS – Applied Biosystems; Chromeleon – Dionex; Analyst – Applied Biosystems). Dada a variedade de configurações implementadas no laboratório, as amostras serão analisadas tendo em consideração a configuração do hardware, ordem de chegada e tipo de análise complementar. |
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| Preço por amostra |
| O preço por amostra depende da qualidade da amostra e da análise pretendida quer ao nível de software quer ao nível da criação dos relatórios. |
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Este equipamento foi financiado ao abrigo do Programa Nacional de Reequipamento Científico através da Fundação para a Ciência e a Tecnologia.
- Programa Nacional de Re-equipamento Científico e do Programa que co-financiou (POCI 2010, FEDER)
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Governo da República Portuguesa |
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União Europeia — Fundos Estruturais |
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